Table 1 Cohort, participant, and shedding characteristics
Participant Location, N (%)a | USA | Peru | Cameroon | Uganda | Kenya | Total |
|---|---|---|---|---|---|---|
102 (41 %) | 7 (3 %) | 32 (13 %) | 68 (27 %) | 39 (16 %) | 248 (100 %) | |
Participant Demographic and Clinical Data: | ||||||
Male, n (%) | 101 (99 %) | 7 (100 %) | 0 (0 %) | 44 (65 %) | 0 (0 %) | 152 (61 %) |
HIV-infected, n (%) | 46 (46 %) | 7 (100 %) | 32 (100 %) | 37 (54 %) | 21 (54 %) | 143 (58 %) |
CD4 countb | ||||||
CD4 < 200 | 9 (20 %) | 0 (0 %) | 0 (0 %) | -- | -- | 9 (6 %) |
CD4 200–499 | 17 (37 %) | 1 (14 %) | 13 (41 %) | -- | -- | 31 (22 %) |
CD4 500+ | 12 (26 %) | 0 (0 %) | 5 (16 %) | -- | -- | 17 (12 %) |
Unknown | 8 (17 %) | 6 (86 %) | 14 (44 %) | 37 (100 %) | 21 (100 %) | 86 (60 %) |
HIV-1 RNAb | ||||||
<104 | 12 (26 %) | 4 (57 %) | -- | 7 (18 %) | -- | 23 (16 %) |
≥104 | 22 (48 %) | 3 (43 %) | -- | 25 (68 %) | -- | 50 (35 %) |
Unknown | 12 (26 %) | 0 (0 %) | 32 (100 %) | 5 (14 %) | 21 (100 %) | 70 (49 %) |
Kaposi sarcoma: | 2 (2 %) | 0 (0 %) | 0 (0 %) | 34 (50 %) | 0 (0 %) | 36 (15 %) |
HIV-associated: | 1 (1 %) | -- | -- | 19 (28 %) | -- | 20 (8 %) |
HSV-2 seropositive, n/tested (%) | 62/97 (64 %) | 7 (100 %) | 31 (97 %) | ND | ND | 100/135 (74 %) |
Cohort Shedding Characteristics: | ||||||
Sessions, | ||||||
Number: | 152 | 7 | 32 | 68 | 39 | 298 |
Observations per session: | ||||||
Median # of days (range) | 33 (15–136) | 56 (27–57) | 19 (14–23) | 29 (14–32) | 29 (26–29) | 30 (14–136) |
Overall shedding: | ||||||
Positive swabs: | 2,213 | 75 | 183 | 389 | 263 | 3,123 |
Total swabs: | 6,660 | 359 | 590 | 1834 | 1,114 | 10,557 |
Percent positive: | (33 %) | (21 %) | (31 %) | (21 %) | (24 %) | (30 %) |
Participant shedding rate per session, | ||||||
Median % (IQR) | 7 (0, 73) | 0 (0, 33) | 18 (0, 56) | 0 (0, 34) | 7 (0, 43) | 4 (0, 54) |
Persons with any shedding | 60 (59 %) | 3 (43 %) | 21 (66 %) | 26 (38 %) | 27 (69 %) | 137 (55 %) |
Quantity, median (IQR) of positive swabs, log10 copies/mL | 4.8 (3.9–5.6) | 7.4 (5.0–7.8) | 3.2 (2.7–3.8) | 5.2 (3.9–6.0) | 4.4 (3.5–5.5) | 4.7 (3.7–5.6) |