Number of Samples | LMP-1 Type | T cell epitope | Â | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  | CTAR 3 | JAK binding site |  | CTAR 2 | ||||||||||||||||||
 |  | Amino acid position | |||||||||||||||||||||
 |  | 313 | 318 | 321 | 322 | 328 | 331 | 334 | 338 | 343 | 344 | 345 | 346 | 347 | 348 | 349 | 350 | 351 | 352 | 354 | 356 | 366 | 372 |
 | B95.8 RefSeq# | S | G | P | Q | E | G | Q | L | G | G | G | H | S | H | D | S | G | H | G | D | S | D |
1 | B' | Â | N | Â | E | Â | Â | R | S | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | R | Â | Â | T | Â |
3 | B' | Â | Â | Â | E | Â | Â | R | S | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | R | Â | Â | T | Â |
2 | B' | Â | Â | Â | E | Â | Â | R | S | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | T | Â |
1 | B95.8 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
1 | B95.8' | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | N | Â | Â |
3 | B95.8' | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | T | Â |
1 | B95.8' | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | N | Â | Â | T | Â |
22 | C | Â | Â | Â | N | Â | Â | R | S | Â | * | * | * | * | * | * | * | * | * | Â | Â | T | Â |
1 | C' | Â | Â | Â | N | G | Â | R | S | Â | * | * | * | * | * | * | * | * | * | Â | Â | T | Â |
2 | C' | Â | Â | Â | N | Â | Â | R | S | Â | * | * | * | * | * | * | * | * | * | Â | Â | T | H |
1 | C' | Â | Â | Â | N | Â | Â | R | S | Â | * | * | * | * | * | * | * | * | * | S | Â | T | G |
1 | C' | Â | Â | S | N | Â | Â | R | S | Â | * | * | * | * | * | * | * | * | * | Â | Â | T | Â |
10 | K' | Â | K | Â | E | Â | Â | R | S | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | T | Â |
11 | K | Â | K | Â | E | Â | Â | R | S | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | R | Â | Â | T | Â |
1 | D' | P | Â | Â | T | Â | Q | Â | P | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | T | Â |