E6 nucleotide position | LCR nucleotide position | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Nucleotide position | 109 | 132 | 143 | 145 | 196 | 255 | 256 | 286 | 289 | 295 | 335 | 350 | 403 | 7386 | 7393 | 7417 | 7435 | 7484 | 7489 | 7520 | 7668 | 7688 | 7713 | 7763 | 7785 | 7787 | 7825 | 7833 | Variant | Class | Cytology |
Predicted amino acid substitution | 2 F | R10I/R10T | Q14D | V31 | C51F | A61 | V62 | D64E | H78Y | L83V | L100 | ||||||||||||||||||||
K02718 | T | G | C | G | G | G | C | T | A | T | C | T | A | G | C | T | G | A | G | G | C | C | T | C | C | A | G | G | |||
CHUA130001 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | E | G350 | LSIL | |||||||||||||||||
CHUA130002 | - | - | - | A | C | A | A | T | A | - | T | T | - | A | T | Af 2 | - | ASC-US | |||||||||||||
CHUA 130003 | - | - | - | A | C | A | A | T | A | - | T | T | - | A | T | Af 2 | - | HSIL | |||||||||||||
CHUA 130012 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | E | G350 | carcinoma | |||||||||||||||||
CHUA 130026 | - | C | G | T | - | - | - | a | g | - | T | - | Af 1 | 1a | Normal | ||||||||||||||||
CHUA 130035 | - | C | G | T | - | - | - | a | g | - | T | - | - | - | - | - | - | - | A | A | - | A | A | T | T | - | - | T | Af 1 | 1a | HSIL |
CHUA 130021 | c | T | G | T | - | - | a | g | - | T | - | g | Af 2 | a | carcinoma | ||||||||||||||||
CHUA 130024 | c | T | G | T | - | - | - | a | g | - | T | - | g | Af 2 | a | ASC-US | |||||||||||||||
CHUA 140002 | c | T | G | T | - | - | - | a | g | - | T | - | g | C | - | - | - | C | A | A | T | A | - | T | T | - | A | T | Af 2 | a | carcinoma |
CHUA140010 | c | T | G | T | - | - | - | a | g | T | - | g | C | - | - | A | C | A | A | T | A | - | T | T | - | A | T | Af 2 | - | Normal | |
CHUL140009 | c | T | G | T | - | - | - | a | g | T | - | g | Af 2 | a | HSIL | ||||||||||||||||
CHUL140002 | c | T | G | T | - | - | - | a | g | T | - | g | C | - | - | A | C | A | A | T | A | - | T | T | - | A | T | Af 2 | a | HSIL | |
CHUL140016 | - | T | - | - | - | A | A | - | A | A | T | T | - | - | T | Af 1 | - | carcinoma | |||||||||||||
CHUA 130025 | - | - | G | T | a | T | T | a | g | G | T | - | - | - | - | C | - | - | A | A | T | A | - | T | T | T | - | T | Af 1 | - | carcinoma |