Evaluation of enterotoxigenic Bacteroides fragilis correlation with the expression of cellular signaling pathway genes in Iranian patients with colorectal cancer

Table 1 Specific primers and TaqMan probes were utilized in the present research

Target gene	Primer/Probe	Oligonucleotide sequence (50e30)	Product size (bp)	Ref
B. fragilis	Primer R Primer F Probe	CGGAATCATTATGCTATCGGGTA CGAGGGGCATCAGGAAGAA CTTGCTTTCTTTGCTGGCGACCG	136	[24]
bft-1	Primer R Primer F	GAACCTAAAACGGTATATGT CCT CTT TGG CGT CGC	190	[27]
bft-2	Primer R Primer F	GAACCTAAAACGGTATATGT CGC TCG GGC AAC TAT	175	[27]
bft-3	Primer R Primer F	GAACCTAAAACGGTATATGT TGT CCC AAG TTC CCC AG	287	[27]
CCND1	Primer R Primer F	CCTCCTTCTGCACACATTTGAA GCTGCGAAGTGGAAACCATC	135	[28]
TP53	Primer R Primer F	TCATCCAAATACTCCACACGC CAGCACATGACGGAGGTTGT	125	[28]
BCL2	Primer R Primer F	CAGAGACAGCCAGGAGAAATCA TCGCCCTGTGGATGACTGA	134	[29]
BAX	Primer R Primer F	TGCCACTCGGAAAAAGACCTC TTTTGCTTCAGGGTTTCATCCA	155	[30]
WNT	Primer R Primer F	GTGGTCCAGGATAGTCGTGC GCGTGTTAGTGTCCAGGGAG	110	[31]
TCF	Primer R Primer F	GTTCATGTGGATGCAGGCTAC GGCTATGCAGGAATGTTGGG	76	[32]
AXIN	Primer R Primer F	CCGTCGAAGTCTCACCTTTAATG GGTTTCCCCTTGGACCTCG	157	[28]
APC	Primer R Primer F	CTGAAGTTGAGCGTAATACCAGT AAAATGTCCCTCCGTTCTTATGG	222	[28]
CTNNB1	Primer R Primer F	CGAGTCATTGCATACTGTCCAT AAAGCGGCTGTTAGTCACTGG	215	[28]
SLCO2A1	Primer R Primer F	ACACTTCTGTGGTCACTCGTC GAGAGATTTGAATGTTGGACAAAGC	89	[24]

ISSN: 1750-9378